1.殺菌消毒，去除病原微生物
污水處理(尤其是生活污水、醫療廢水)中含有大量細菌、病毒、寄生蟲卵等病原微生物，
次氯酸鈉通過釋放游離氯破壞微生物的細胞膜、蛋白質和核酸，使其失去活性，避免處理后水質對環境或人體健康造成危害。
2.氧化分解有機污染物
次氯酸鈉的強氧化性可分解部分難以生物降解的有機污染物(如酚類、氰化物、硫化物等)，降低污水中的化學需氧量(COD)和生化需氧量(BOD)，提升污水的可生化性或直接去除污染物。
3.脫色、除臭
污水中因含有色素(如工業廢水的染料、生活污水的腐殖質)或異味物質(如硫化氫、氨類)，會導致水體變色、發臭。次氯酸鈉可通過氧化作用破壞色素分子結構，實現脫色；同時氧化分解硫化氫、硫醇等惡臭物質，消除異味。尤其適用于印染廢水、食品加工廢水等有色或易產生異味的污水處理。
4.破壞水中藻類
污水處理過程中，水體富營養化可能導致藻類滋生，次氯酸鈉可氧化藻類細胞，其繁殖；同時分解藻類產生的毒素，避免毒素殘留對環境造成危害。
